袁世凯去世后，华夏开始了长达13年的军阀割据时期。北平权利连续被北洋军阀系统控制，但此时没有一个人具有足够能力单独控制整个北洋系统的军队和政权，各不同派别的领导人以省为单位依靠自己的军事力量形成了地方的军阀和实际上的割据局面。军阀们展开了相互的混战以夺取北平北洋政府的政权。名义上各势力仍受北平中央政府（即北洋政府）支配，但北洋政府实际上在不同时期也由不同派别军阀统治。大大小小的战役不断，如“直皖战争”、“直奉战争”等导致帝国主义在华夏扩张势力。

　　1916年北洋政府虽短暂回归双首长制，不过仍发生府院之争的混乱场面。1916年6月7日，作为前革命党人的副总统黎元洪继任总统，袁氏亲信段祺瑞出任国务总理。二者争执不断，史称府院之争。两人的第一次矛盾发生在中华帝国崩溃之后，恢复中华民国是依据1912年的《临时约法》还是依据1914年的《中华民国约法》这一问题。作为前革命党人的黎元洪支持前者，而作为袁世凯亲信的段祺瑞则支持后者。经过争论，两方同意中华民国的恢复依据1912年的《临时约法》，解散1914年袁世凯设立的旧国会，并任命段祺瑞为新国会的总理。作为交换，革命党人同意解散军事委员会。

　　1917年，两人就华夏是否参与第一次世界大战为由发生矛盾。1917年5月14日，段祺瑞未经国会和总统的许可，便宣布华夏对D国宣战，并利用他的亲信将领和军队要求黎元洪解散国会。作为反击，黎元洪解除了段祺瑞的总理职务。而段祺瑞就离开北平，拥兵对抗黎政府，使得众多省份宣布独立，并在决定向北平进军。这使得黎元洪不得不求助于安徽督军张勋。

　　1917年6月7日，张勋从徐州率五千辫子兵入平拥立清朝末代皇帝溥仪即位，宣布复辟。黎元洪拒绝接受，并协请段祺瑞主持讨伐。复辟仅持续12天被段祺瑞讨平。黎元洪宣告辞职，由副总统冯国璋继任总统，段祺瑞续任*****。1918年8月12日重新选举的国会中，段祺瑞控制的安福派系通过贿选等手段获得330多席，成功得控制了国会，被称为安福国会。8月14日，国会通过了对德宣战的决议。

　　在此时，孙中山于1917年7月在广州设立军政府，拥护1912年的《临时约法》，开展了护法运动以反对北洋政府。对此问题，作为主和派的冯国璋与主战派的段祺瑞时有冲突。最后冯国璋总统任期结束，冯段二人相约共同下野，由袁世凯的老朋友，前清元老兼当过国务卿的徐世昌接任总统，而段氏的皖系在背后操纵政权。

　　此后皖系

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